Особености:
1) Появилась возможность выбирать и играть за секретных бойцов и боссов: KINTARO(ВЛЕВО на LIU KANG), SHAO KAHN(ВЛЕВО на SUB-ZERO), NOOB SAIBOT(ВПРАВО на REPTILE), SMOKE(ВПРАВО на JAX) и JADE(вправо на RAYDEN);
2) Теперь все бойцы полностью играбельны (нет зависаний при их выборе посредством ARTMONEY);
3) Бывшим секретным бойцам добавлены добивания и возвращены их суперудары;
4) При игре за боссов также можно пользоваться их суперударами;
5) На бывших секретных бойцах можно делать добивания;
6) Добавлена новая строка в меню игры - PREFERENCES. И суб-строки в ней: Combo Mode, Endurance Mode, Sound Speed;
7) Добавлен режим ENDURANCE MODE, причем команду выбирает непосредственно сам игрок. Максимальное кол-во бойцов в команде - 8;
8) Добавлен режим практики - PRACTICE MODE;
9) Добавлен комбо режим. В этом режиме у игрока появляется возможность использовать комбы, причем комбинацию надо полностью набирать игроку, т.е. автоматом это не делается после нажатия одной кнопки(!!!) У каждого бойца по 6 комб;
10) Добавлены/возвращены звуки из аркадной версии МКII. Теперь имена всех бойцов озвучиваются, есть сообщения о победе бойца, о выборе бойца, при исполнении добивания, ROUND, кое-какие крики и многие другие;
11) Добавлены 6 арен из МК1;
12) Добавлены несколько муз. треков из МК1 к этим аренам;
13) Добавлено новое добивание - BRUTALITY. Так же как и в UMK3 комбинацию сначала полностью набирает игрок(!!!), затем уже комп 'добивает' проигравшего;
14) Добавлен бег всем бойцам кроме боссов;
15) В конце боя повысилась вероятность проведения компьютерным игроком добивания.